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新冠病毒会变异吗?这群“技术宅”用基因测序

时间:2020-08-11 06:34:20    来源:     浏览次数:0    

2月2日晚8时,南京闹市区的江苏路,行人寥落,车辆稀疏。但坐落在此的江苏省疾病预防控制中心(以下简称江苏省疾控中心)灯火通明,4楼的病原微生物实验室里脚步匆匆、热闹不已。

“今晚的检测报告大约多久能出来?”

“大概9点半到10点.”

“一会还有一批样本马上到。”

实验室内外,大家传递着有关检验的最新消息。

疫情发生以来,江苏省13个设区市疑似新冠病毒肺炎的初筛阳性标本,都会送到这里复核确证。实验室内,检验人员受理着病毒样品,提取核酸、加样,上机检测,基因测序。

密闭的负压生物安全二级实验室里做核酸提取的检验人员 金凤 摄

江苏省疾病预防控制中心急性传染病防制所副主任技师田华,在密闭的负压生物安全二级实验室,身着隔离衣、防护服,戴着N99口罩、护目镜,套着鞋套,靴套和两层医用乳胶手套,从接收的各设区市新冠病毒咽拭子标本里提取病毒RNA。

隔着实验室玻璃窗看起来,全副武装的田华像一个臃肿的“小黄人”。

“在里面连续做了3个多小时的实验,头晕得要命。”实验结束后,田华终于卸下一身疲惫。她告诉科技日报记者,因为新冠病毒传染性高,所以每一步操作都小心翼翼、精神高度紧张,刚才才做了一个多小时,就有点晕厥的感觉。“我告诉自己,扛住扛住,把这批做完就出来了,拼了。否则出去再进来,一来耗费医疗物资,二来增加感染风险,三来同事还等着出具核酸检测报告。”

田华(右一)与同事邓斐 受访者供图

如今,检验人员每天3班24小时轮班,他们在负压实验室一“憋”就是三四个小时。在进实验室前都不敢喝水,吃东西。从拿到样本到出具检测报告,时间约为6小时左右。

进实验室前的检验人员 金凤 摄

1月10日,中国公布新冠病毒全基因组序列。但

把构建好的测序文库转入检测试剂盒 受访者供图

高通量基因测序技术,是江苏省疾控中心应对新冠病毒的杀手锏,“”该中心病原微生物研究所所长崔仑标说,借助该技术,2013年他们曾检出H7N9和H3N2两种亚型的流感病毒可以同时感染人。2016年检出一种新型环状病毒。

崔仑标介绍如何用高通量测序技术为新冠病毒测序。金凤 摄

该中心病原微生物研究所技师赵康辰,正向装有病毒核酸的试剂管中添加反应酶。“同事做好核酸提取后,我会用反应酶将核酸片段化,再加入磁珠,吸附病毒的核酸,去除人基因组、试剂残留物等杂质。经过吸附、清洗,再将磁珠上的病毒核酸洗脱下来,加上分子标签,连接到测序仪上,检测病毒核酸序列。”赵康辰说,

赵康辰将测序试剂盒加入测序仪。受访者供图

目前,江苏省疾控中心已经做了十多例新冠病毒的高通量测序。“我们也会挑选一些重症病例和轻症病例做基因组的比较,看看两类人群携带的病毒基因是否有差异。”崔仑标说。

崔仑标与工作人员在调试测序仪。金凤 摄

行走在病原微生物实验室,擦肩而过的多是80后、90后。1月20日以来,他们已经连续工作近半月,有的退了回家过年的车票留在南京,有的甚至住在办公室。

从除夕到初三,赵康辰一直在实验室没回家,瞌睡了就趴下打个盹。该中心病原微生物研究所副主任医师吴涛、陈银、朱小娟等人春节期间留守南京,与家人分隔两地。

崔仑标是扬州人,今年过年,他和身为医生的妻子都默契地选择留在南京。“国家养兵千日,用兵一时,现在到我们亮剑的时候了。”

这个已有两个孩子的爸爸,已经十多天没有跟儿子们说话了。每天深夜到家,儿子们已经睡去,上班时,儿子们还未睡醒。

但“战斗”着的崔仑标并不孤单。前几天晚10点,他突然接到一个外卖小哥的电话,下楼一看,不知是哪位热心人士送来的鸭血粉丝汤和热乎乎的卷饼。“你们真不容易。”小哥的一句话,让崔仑标暖心到现在。

2020年2月2日20时20分实验室检验人员合影。金凤 摄

“崔博(士)快来,我们一起拍一张合影,20:20啦。”当时钟指向20:20,崔仑标被实验室外的年轻同事们招呼着,2020年2月2日20时20分就这样定格在他们的人生中。

来源:科技日报

编辑:李俊霞

审核:王小龙

终审:冷文生

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